Второе отделение специализируется на консервативном и хирургическом лечении воспалительных и гнойно-септических заболеваний женских половых органов.

В отделении проводится лечение больных: с острыми воспалительными заболеваниями женской половой сферы; с осложнениями после медицинских абортов, самопроизвольных абортов; с гнойно-септическими осложнениями после родов, оперативных вмешательств; с хроническими воспалительными заболеваниями в сочетании с бесплодием, с применением иммунокоррекции. 

Проводится оперативное лечение больных с тубоовариальными гнойными опухолями, по поводу миомы матки с нарушением трофики узлов.
В отделении применяется комплексный подход к лечению, включающий в себя современные эфферентные методики терапии, иммунокоррекцию, антибактериальную, противовирусную, инфузионную и витаминотерапию, местное лечение.

Для эффективного лечения и профилактики хронических воспалительных заболеваний разработаны новые, перспективные программы с использованием современных методов терапии. В лечении острых воспалительных заболеваний применяется прогрессивная методика динамической лапароскопии, что позволяет сохранять репродуктивное здоровье пациенток.